
Pymatflow工具简化计算流程的内容。话不多说,本文将为您带来SIESTA系列教程中的体系结构优化部分。

matflow命令来使用SIESTA进行体系结构的优化。


SIESTA来优化离子位置,只需使用
matflow一条命令即可:
~$ matflow siesta -r 1 --kpoints-mp 3 3 3 0 0 0 -d nacl-opt --cif nacl.cif --meshcutoff 300
nacl-opt目录,然后在其下自动生成输入文件并进行作业任务的提交。默认使用PBS作业调度器。
--server指定其它服务器类型,比如吕梁天河二号超算系统请使用
--server llhpc参数。如果你只是想在本地单节点运行,请使用以下参数组合:
--runopt genrun、
--auto 0。
~$ postflow siesta -r 1 -d nacl-opt



Pymatflow
是一个用于第一性原理模拟的工作流自动化管理软件,目前支持的计算程序有VASP、Qutum ESPRESSO、Abinit、SIESTA、CP2K。项目文档地址: http://pymatflow.readthedocs.org/ 中文手册: https://pymatflow.readthedocs.io/en/latest/manual_cn.html 此公众号为 Pymatflow
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