01 NHANES数据库介绍
NHANES是比较有名的公共数据库,虽然已经有前人发过不少文章。但主要肯挖掘,还是有好文章产出。(以一篇BMJ文章为例:Weight change across adulthood in relation to all cause and cause specific mortality: prospective cohort study,真正诠释了啥叫不起眼的数据发大文章,所以说重要的还是idea)
美国国家健康与营养调查( NHANES, National Health and Nutrition Examination Survey)是一项基于人群的横断面调查,旨在收集有关美国家庭人口健康和营养的信息。项目每年调查一个全国代表性的样本,约5000人,这些人群位于全国各县。NHANES访谈部分包括人口统计学、社会经济学、饮食和健康相关问题。体检部分包括生理测量、实验室检查等内容。
当然介绍的再多都不如自己去网站逛一逛https://www.cdc.gov/nchs/nhanes/index.htm
02 NHANES数据库使用教程(以SAS为例)
下载数据:

以2005-2006的人口学数据为例,点击画红框的区域即可下载,数据为xpt格式
代码下载:
filename xptIn url "https://wwwn.cdc.gov/nchs/nhanes/2015-2016/DEMO_I.xpt";libname xptIn xport;导入数据:
(1) 网页下载数据集导入:
libname XP xport "C:\NHANES\DATA\DEMO_I.xpt"; /*改成相应的硬盘地址*/data demo_i;set xp.demo_i;run; /*复制到work数据集,也就是临时数据集*/data mydata.demo_i;set xpt.demo_i;run; /*复制到mydata数据集,也就是永久数据集*/
(2) 下载数据集导入:(只需要复制的步骤)
data demo_i;set xp.demo_i;run; /*复制到work数据集,也就是临时数据集*/data mydata.demo_i;set xpt.demo_i;run; /*复制到mydata数据集,也就是永久数据集*/
XPT文件格式批量导入(提高效率必备):.xpt扩展也被称为通常由SAS应用创建的数据格式,或许这就是为什么双击xpt文件也能打开的原因(当然双击的效率相较于代码还是略低)
批量导入的话肯定要用到宏程序(需要修改的地方只有三处,均已中文注释):
/* The code below creates a transport file in the temp folder for use by the macro */libname testlib xport 'D:\NHANES\trans.xpt'; /*修改为存放xpt数据集的硬盘位置*/proc copy in=sashelp out=testlib;select retail;run;/* Note: Macro starts here *//* Macro using PROC COPY and the XPORT engine for reading transport files*/%macro drive(dir,ext,out);%let filrf=mydir;/* Assigns the fileref of mydir to the directory and opens the directory */%let rc=%sysfunc(filename(filrf,&dir));%let did=%sysfunc(dopen(&filrf));/* Returns the number of members in the directory */%let memcnt=%sysfunc(dnum(&did));/* Loops through entire directory */%do i = 1 %to &memcnt;/* Returns the extension from each file */%let name=%qscan(%qsysfunc(dread(&did,&i)),-1,.);/* Checks to see if file contains an extension */%if %qupcase(%qsysfunc(dread(&did,&i))) ne %qupcase(&ext) %then %do;/* Checks to see if the extension matches the parameter value *//* If condition is true, submit PROC COPY statement */%if (%superq(ext) ne and %qupcase(&name) = %qupcase(&ext)) or(%superq(ext) = and %superq(name) ne) %then %do;libname old xport "&dir.\%qsysfunc(dread(&did,&i))";libname new "&out";proc copy in=old out=new;run;%end;%end;%end;/* Close the directory */%let rc=%sysfunc(dclose(&did));/* END MACRO */%mend drive;/* Macro call *//*First parameter is the source folder, the second parameter is extension being *//*searched for, and the third parameter is the target directory for the *//*converted files. */%drive(D:\NHANES,xpt,D:\NHANES\) /*前后修改为存放xpt数据集的硬盘位置,后一个多一斜杠*/
03 下一期内容预告
介绍数据集以及研究设计基础知识及权重的使用
04 参考内容
郭晓娟, 田国祥, 等. NHANES项目介绍及数据提取流程.[J]. 中国循证心血管医学杂志, 2019, 6(11):654-657. https://wwwn.cdc.gov/nchs/data/tutorials/file_download_import_SAS.sas https://support.sas.com/kb/33/918.html https://www.cdc.gov/nchs/nhanes/index.htm https://www.reviversoft.com/zh-cn/file-extensions/xpt




