在启动MySQL后可以通过查看MySQL的进程，看看是否有设置使用指定的目录的my.cnf文件，如果有则表示MySQL启动时是加载了这个配置文件。

命令：pa -ef | grep mysql | grep 'my.cnf'

如果上面的命令没有输出，那么表示没有设置使用指定目录的my.cnf，若有输出则表示使用的是输出中的文件。