稳定性较低：由于开源数据库的源代码可以由任何人进行修改，这可能导致在某些特定情况下，数据库的行为表现不如预期。而商业数据库的源代码由专门的团队进行维护和优化，稳定性更有保障。

性能问题：开源数据库在处理大数据量或者复杂查询时，可能会出现性能问题。商业数据库通常采用一些优化算法，如优化查询计划、数据压缩、高效的索引结构等，能够提供更高的查询性能和数据处理能力。

技术支持较弱：虽然开源数据库有社区提供支持，但社区的支持往往无法与商业数据库提供的专业技术支持相比。商业数据库通常有专门的技术支持团队，用户在遇到问题时，可以直接联系技术支持团队获取专业的帮助和解决方案。

安全性较低：开源数据库的源代码是开放的，这意味着黑客可以查看源代码，寻找潜在的漏洞进行攻击。虽然开源社区通常会及时修复已知的安全漏洞，但新的安全问题可能随时出现。而商业数据库通常会有专门的安全团队，专注于数据库的安全问题，能够更好地保护数据库的安全。

高级功能缺失：一些高级的数据库功能，如分布式事务、高级索引等，往往只有商业数据库才提供。开源数据库由于资源和技术限制，可能无法提供这些高级功能，在需要这些高级功能的场合，开源数据库可能无法满足需求。