你是异构数据库迁移吗？如果是从mysql到mysql应该自增主键不会失效的。异构迁移的话，根据你目标端所支持的类型，比如oracle就是创建序列来实现。

create sequence seq_id increment by 1 start with 1; 

假设你迁移过来的表为t1,原来的自增主键为id列，则在oracle中执行：

update t1 set t1=seq_id.nextval;
commit;